В третьем фильме защита киборгов требуется юноше Сабе, отца-учёного которого похитили Зоа в надежде восстановить тайны Вихря, супергалактики, таинственного энергетического источника в открытом космосе, находящегося под контролем бесконечного источника власти. В команду киборгов вошёл доктор Космо, который жаждет обзавестись именно этим источником энергии. Когда избранник Зоа, Гаро, похищает профессора Космо и 001, сверхчувствительного киборга размером с новорожденного, команда решает начать сражение, путешествуя на борту корабля Сабы во внешние галактические пределы.