Действие кинофильма «Пандемия» происходит в Токио. Главный герой – молодой парень по имени Цуоши Мацуоко. Он работает в больнице доктором. Обычный день, к нему как всегда приходит очередной пациент. Осмотрев его, Цуоши ставит ему диагноз обычной простуды. И это становится его ошибкой, которая впоследствии будет стоить жизни миллионам людей. Его пациент внезапно умирает. Доктор в недоумении, ведь простая простуда не могла дать такого осложнения. И до него начинает доходить, что на самом деле это чрезвычайно серьезная болезнь. Ею может заразиться все население планеты. Болезнь прогрессирует и очень быстро распространяется. Вокруг начинается хаос и настоящая эпидемия. Помощником Мацуоко становится доктор Эико Кобэяши. Совместными силами они начинают искать истоки болезни. Главное узнать причину ее возникновения. И тогда можно будет создать лекарство и спасти жизнь на Земле. Впереди много испытаний. Молодым людям нужно преодолеть все и постараться самим не заразиться. На их плечах груз ответственности за всех людей.