Нектарий Эгинский чувствует свою связь с богом. С каждым днём это ощущение становится всё сильнее. Его вера крепнет, а сам он решает строго следовать библейским заветам. Герой фильма «Человек божий» живёт в небольшой общине, предпочитая постоянно помогать окружающим. Для других он готов сделать гораздо больше, чем для себя. И поэтому, когда он встречает на своём пути несчастного и измученного нищего, шагающего по раскалённой земле голыми ногами, то предлагает ему свою последнюю пару обуви. Несмотря на свои поступки, герой фильма «Человек божий» сохраняет скромность. Однако именно благодаря этому ему удаётся стать одним из самых почитаемых людей в округе. Через некоторое время Нектарию удаётся стать митрополитом. Однако его добрые поступки и благочестие, а также популярность среди паствы вызывают завить в высших слоях египетского духовенства. Священники опасаются, что Нектарий может стать следующим главой их церкви. Пытаясь найти способ отгородить себя от него, высшие слои духовенства дискредитируют Нектария и выводят из страны. Хотя один высокопоставленный чиновник продолжает верить в него. Он помогает ему перебраться на Афон.