После того как Пол Атрейдес потерял все, он обращается за поддержкой к народу Арракиса - фрименам. Он понимает, что чтобы завершить свою миссию и преобразить Дюну, ему необходимо погрузиться в их культуру, понять их обычаи и выживать в суровых условиях пустыни, где обитают огромные черви и находится ценное сырье под названием «спайс». Однако в своих видениях Пол видит ужасное будущее: победа над Великим Домом барона Владимира Всемирного Зла приведет к Священной войне, охватывающей всю вселенную. Он решает предотвратить это, становясь пророком Муад’Дибом из местных легенд. Некоторые фримены видят в нем Мессию, которого так долго ждали, но другие смотрят на него с подозрением. Пол не особенно рад этой роли, но, пройдя через несколько сложных испытаний, он соглашается принять имя Муад’Диб. Теперь перед ним стоит задача выбрать свой собственный путь и остановить ужасы грядущей войны. Кроме того, ему предстоит наладить отношения с Чани, сильной и волевой женщиной из фрименов. Этот фильм является продолжением «Дюны» и основан на второй половине одноименного научно-фантастического романа Фрэнка Герберта.