В центре сюжета фильма «Детективы из табакерки и сокровища морских глубин» оказывается женщина по имени Ясвиндер, работающая морским биологом. Несмотря на свой опыт и энтузиазм, она оказывается в большой опасности. Сначала неизвестные отправляют ей письма с угрозами, что приводит к постоянному стрессу. А после этого злоумышленник врывается в её лабораторию, чтобы украсить ценные экземпляры. Но на этом всё не заканчивается. Вскоре Ясвиндер загадочным образом исчезает с исследовательского судна, где она долгое время занималась научными работами. К счастью, у Ясвиндер остался сын. И он обязательно докопается до истины, найдя мать и освободив её. В своём путешествии главный герой фильма «Детективы из табакерки и сокровища морских глубин» не будет одинок. Вскоре к нему присоединится его близкая подруга Алиса. Им предстоит раскрыть одно из самых опасных дел в своей жизни. Несмотря на все осложнения, ребята уверены, что им удастся восстановить полную картину произошедшего и найдя виновных.