Сюжет фильма «Миссия ассасина» начинается в тот момент, когда конфликты между специальными правительственными службами и способы их решения становятся всё более изысканными и сложными. В какой-то момент агенты даже получают в своё распоряжение самые передовые технологии, опережающие своё время. Одна из таких технологий позволяет специальным агентам вселяться в тела других людей. Однако используют они эти методы не для борьбы с преступностью, а для того, чтобы устранять нежелательные цели, используя для этого руки друзей и близких своих жертв. События приобретают внезапный поворот в тот момент, когда Алексе удаётся узнать о том, что её возлюбленный, находящийся сейчас в состоянии комы, в действительности является одним из множества таких «спящих» оперативных агентов. И теперь героине фильма «Миссия ассасина» нужно найти способ спасти его. В это же время узнаётся о том, что переход в другие тела не может оставаться бесследным для человека. Используя технологию, можно потерять связь с реальностью. В какой-то момент можно затеряться среди других тел, полностью потеряв собственную личность.