Cиндзи Икари получает телефонный звонок от отца из штаб-квартиры NERV — организации, воюющей с таинственным врагом. Последняя надежда человечества в этой войне — Евангелион, человекоподобное оружие, и почему-то именно Синдзи, замкнутому юноше, обремененному грузом психологических проблем, предстоит быть его пилотом…