Метрополис оказался под угрозой из-за злодеев, и в это непростое время Скуби-Ду и его верные друзья, Шэгги, Дафна, Велма и Фред, решают объединить свои усилия с Крипто, суперсобакой, чтобы помочь Лиге Справедливости и найти пропавших членов команды. Они отправляются на захваченную злодеями территорию, где им придется разгадать загадки, раскрывать тайны и справляться с опасными испытаниями, чтобы вернуть порядок и спасти Метрополис от зла.