Данная история происходит по истечению истории, которая описана в первом фильме. Стенли Маус, хочет найти племя котов, которое затерялось в Африке. Он-то находит их, но мышиные семьи, становятся эпицентром их внимания. Ник Грабовский – спец агент, должен навести порядок, и спасти мир от хаоса...