Героем истории сериала «13 клиническая» оказывается опытный и очень талантливый хирург по имени Кирилл. Будучи неизлечимо больным врачом, он устраивается на работу в весьма необычное лечебное заведение, функционирующее ещё с Советских времён под номером 13. Оказавшись на месте, герой сериала «13 клиническая» внезапно выясняет, что все местные пациенты страдают от результатов вмешательства сверхъестественных сил, представляя угрозу как для них самих, так и для окружающих. Все случаи здесь уникальны и требуют индивидуального подхода. Природа сил зла различна, а побороть её очень сложно. Несмотря на серию всех этих странных событий, Кирилл довольно быстро осваивается. Для него главной задачей становится демонстрация руководству и начальству своей компетентности. Кирилл хочет доказать окружающим и самому себе, что он может принести большую пользу. И пусть обстоятельства несколько отличаются от того, к чему он привык, Кирилл будет стараться до последнего вздоха. Но чем дольше Кирилл здесь работает, тем больше осознает, что грань между добром и злом очень подвижна. В какой-то момент он и сам становится одержимым.