Действие сериала «Знахарь» начинает своё развитие в тот момент, когда молодой, но очень талантливый нейрохирург Павел решает вернуться в родной Санкт-Петербург после длительной учёбы и практики за границей. После этого он устраивается работать в одно из отделений местной больницы. Вскоре выясняется, что начальник учреждения — его учитель. Если поначалу для Павла всё идёт хорошо, то немного позже выясняется, что не все рады его внезапному появлению. Бывший сокурсник Сергей вступает в открытую конкурентную борьбу, видя в нём своего врага. Но не только на работе проблемы поджидают главного героя сериала «Знахарь». За её пределами его жизнь полна трудностей и испытаний. Одновременно с этим начальник просит провести сложнейшую операцию, удалив опухоль в тяжёлой стадии. Параллельно у Павла завязывается роман с его дочкой. Несмотря на выпавшую серию испытаний, молодой врач хорошо справляется с ними. Но внезапно всё меняется. Случай приводит его к потере памяти. Но Павлу удаётся сохранить способность и желание помогать нуждающимся людям.