Для того, чтобы выжить, отряд Локк должен работать с Рэндаллом Аикеном (Стивен Вэддингтон), являющийся командиром колониальной охраны. А кроме этого сотрудничать с его людьми, стремясь совместно найти то место, где находится биологическое оружие. В результате поисков они оказались в необычном инопланетном артефакте: отчасти работающей Установки 04, которая была разрушена еще в первой игре halo. Постепенно порученное им задание становится очень тяжелой борьбой за выживание.