События фильма «Третья мировая война» начинают развиваться спустя ровно одиннадцать лет после войны в Персидском заливе. На огромном по своим масштабам туристическом лайнере, получившим название «Американский гимн» и способным поместить на своем борту более полутора тысяч человек, неожиданно вспыхивает неизвестная эпидемия. Она начинает распространяться настолько быстро, что под угрозой оказываются все присутствующие. Вскоре эпидемия заражает всех, кто находится на борту, поэтому власти, следящие за ситуацией, пытаются остановить зараженный корабль намного раньше, чем он окажется на суше. В результате попытка оказывается удачной. Но оперативные действия оказываются лишь началом длительного расследования, в центре которого оказывается Ларри Салливан, действующий агент ФБР. Его знакомят со всеми материалами дела, и вскоре выясняется, что информация до него донесена была не просто так. Теперь главный герой фильма «Третья мировая война» должен попытаться узнать о возможности повторения угрозы и договориться с создателем вируса о сотрудничестве. В его руках судьбы тысяч людей.