Адам — сын рыбака из северного города Манзала, получающего известие от местного имама о том, что он в числе тех, кто удостоен щедрой государственной спонсорской помощи для изучения исламской мысли во всемирно известном каирском университете Аль-Азхар. Это головокружительная честь. Оказавшись в университете, герой фильма «Заговор в Каире» испытывает благоговейный трепет перед дисциплиной, строгостью и атмосферой набожности, но также смущается, когда однокурсник предлагает ему сигарету — из всех дурацких вещей — и приглашает его на светскую ночь в городе. Их центр обучения ошеломлён, когда его стареющий главный имам умирает замертво от сердечного приступа, обращаясь к студенчеству, и сразу же начинается политическая борьба со стороны других имамов относительно того, кто займёт положение с огромным политическим влиянием. Замешательство и страдания героя фильма «Заговор в Каире» усугубляются, когда он становится свидетелем того, как его нового приятеля-студента убивают нападавшие в масках, и вскоре с ним связывается растрёпанный и циничный агент разведки, полковник Ибрагим.