На борьбу с общим врагом выходят лучшие друзья. Это любимая подруга Эйприл, отважный и храбрый Кено готовый придти всегда на помощь в трудную минуту. И, конечно же, профессор Джордан Пери - самый умный и конструктивно мыслящий герой, который подскажет правильное решение в сложившейся ситуации.В городе появляются мутанты Токка и его друг Разар. Эти преступники и хулиганы нападают, разоряют жилища жителей Нью-Йорка. Грозят расправами над всеми жителями города! Но кто врагов-мутантов остановит? Кто придет на помощь горожанам? Смелые черепашки начинают борьбу с Шредером, но неосторожно дав ему ответный удар, злодей падает в ядовитую смесь и превращается в Шрендера с удвоенной силой зла! Супер-пупер злодей! Теперь Рафаэлю и его компании придется сражаться с тремя мутантами злодеями!