Сюжет картины «Повелитель кукол: Ось зла» разворачивается в 1939 году, когда идет неумолимое противостояние фашистским захватчикам. Главному герою Дэнни Кугану абсолютно случайно удается завладеть сундуком с волшебными куклами Андре Тулона. Тулон был убит, после чего его дух решил вселиться в деревянные тела этих кукол, за счет чего они оживают. Став новым обладателем мистических кукол, Дэнни вместе с ними начинает сражение против фашистов Клауса и Макса. Но у противников еще есть и помощница – японская диверсантка Одзу. Но у Дэнни то же есть козырь в рукаве – кукла-ниндзя, готовая служить своему повелителю. Новому персонажу отдан приказ напасть на японку и эта кукла-ниндзя тут же приступает к выполнению. Такой находкой Дэнни обзавелся, когда открыл один из тайников этого сундука.