Пёс по кличке Тоби живёт в любящей и заботливой семье, предпочитая проводить большую часть своего времени на заднем дворе дома. Он ни в чём не нуждается и вполне счастлив. Однако никто из владельцев собаки даже не догадывается, что их питомец, главный герой фильма «Агент Тоби Баркс», на самом деле является одним из самых ценных правительственных оперативников. Однажды подростки Кейт и Брет, живущие в доме с любимым псом, обнаруживают, что их тётушка пропала. Они начинают её поиски и вскоре узнают о том, что она была похищена безумным злодеем. Подросткам удаётся выяснить, что преступник планирует захватить мир и поработить всё человечество. Ребята не могут этого допустить, поэтому сразу же отправляются на помощь к тётушке. Одновременно с этим подростки из фильма «Агент Тоби Баркс» выясняют, что их любимая собака уже долгое время служит в правительстве США. Пёс объединяет силы со своими хозяевами, чтобы сразиться со злодеем и разрушить его преступные планы. Впереди героев ждут удивительные приключения, опасные враги и новые знакомства. Взрослея и обучаясь у своего домашнего любимца, ребята будут спасать мир.