Сюжет фильма «Кукольник» начинает своё развитие в самом конце 90-х годов прошлого века. Несмотря на то, что кардинальные изменения давно позади, миллионы людей всё ещё пытаются наладить свои жизни. В этих условиях оказывается 13-летняя девочка-подросток по имени Соня. Вместе со своей матерью и младшей сестрой Анной она вынуждена отправиться в деревню, где им предстоит пожить какое-то время. И такая перспектива ей не очень нравится. Окружающая обстановка кажется Соне слишком депрессивной и мрачной. Она пытается завести друзей среди местных жителей, но отношения никак не складываются. Ситуацию могли бы спасти развлечения, но в деревне их не так много, как бы ей того хотелось. И что же делать в этом случае? Пытаясь найти ответ на этот вопрос, героиня фильма «Кукольник» решает забраться в старый заброшенный дом. Согласно легендам местных ребят, в этом месте покоится зло. Некоторые верят, что здесь может обитать некий Кукольник, ворующий детей и создающий из их тел марионеток. Соня во всё это не верит, поэтому берёт с собой Аню. Но после того, как они выходят из заброшенного здания, с сестрой Сони начинают происходить странные и необъяснимые вещи.