Харухи Судзумия — эксцентричная ученица старшей школы. Её мало интересуют обычные люди, а всё её внимание сосредоточено исключительно на сверхъестественных событиях. Героиня аниме «Меланхолия Харухи Судзумии» и не скрывает этого, гордо заявляя своим одноклассникам, что хочет общаться только путешественниками во времени, инопланетянами и экстрасенсами. Пытаясь найти людей из параллельных миров, пришельцев и гостей из будущего, Харухи решает создать «Команду SOS». Её участникам предстоит установить контакт с внеземными мирами, инопланетными формами жизни и путешественниками во времени. Кён — одноклассник героини аниме «Меланхолия Харухи Судзумии». Непрекращающаяся серия её эксцентричных поступков кажется ему странной. Он пытается узнать Харухи получше, но она всем своим видом показывает ему, что простые школьники её мало интересуют. После этого Кён начинает интересоваться её поступками ещё больше. Узнав о том, что Харухи игнорирует почти всех учеников, он решает стать частью её команды. Вскоре к ним присоединяются ещё несколько человек. Возможно, кто-то из них может быть тем, кого ищет Харухи.