Действие аниме «Эдем» разворачивается в мире альтернативного будущего. Здесь нет человеческой цивилизации, но есть разумный искусственный интеллект, понимающий необходимость совместного сосуществования с природой. И поэтому роботы в этом мире сохраняют тишину и спокойствие. Каждый день они ухаживают за деревьями, цветами и растениями. Роботы берегут природу, видя в ней свою среду обитания. Однажды двое роботов обнаруживают загадочную капсулу. Они решают не проходить мимо, а исследовать странный объект. Внутри они находят человеческого детёныша. Несмотря на то, что им нужно обязательно сообщить о находке, чтобы вместе с другими роботами понять, что делать с ребёнком, герои аниме «Эдем» решают сокрыть информацию о найдёныше. Вместо этого они прячут малыша и начинают заботиться о нём. Проходят годы. Молодая девушка Сара задаётся непростыми вопросами о своём месте в этом мире. Она не понимает, какая серия событий привела её сюда и в чём её предназначение. Но Сара обязательно это выяснит.