Действие мультсериала «Звездный путь: Вундеркинд» разворачивается в 2383 году. Знаменитый на весь Звёздный флот экипаж корабля «Вояджер» возвращается домой. Их путешествие кажется невероятным. Случайно оказавшись на огромном расстоянии от родных краёв, они провели много лет в пути, отыскивая дорогу домой и стараясь избегать врагов. В центре истории мультсериала «Звездный путь: Вундеркинд» оказывается разношёрстная команда, состоящая из представителей самых разных рас, по воле судьбы оказавшихся вместе в Дельта-квадранте. Именно им удаётся обнаружить легендарный корабль «USS Protostar», принадлежащий Звёздному флоту. Серия обстоятельств вынуждает героев взять корабль под свой полный контроль. На нём они отправятся навстречу невероятным приключениям. Но им предстоит многому научиться. Кто будет капитаном? Кто станет первым офицером? Кто будет офицером по науке? Кому удастся взять на себя обязанности главного инженера? А ведь ещё нужны хорошие пилоты и связисты. Помогать в решении этих задач им будет Кэтрин Дженуэй, капитан корабля «Вояджер».